Saúde|Variantes e mutações do coronavírus
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Variantes e mutações do coronavírus

Cada coronavírus contém cerca de 30.000 letras de RNA. Essa informação genética permite que o vírus infecte células e as sequestre para fazer novos vírus.

Diagrama do

CORONAVÍRUS

GENOMA

Espinho

CORONAVÍRUS

Genoma de RNA

Começar de

genoma

30.000

Letras de RNA

À medida que uma célula infectada cria novos coronavírus, ela ocasionalmente comete pequenos erros de cópia chamados mutações. Os cientistas podem rastrear mutações à medida que são transmitidas através de uma linhagem, que é um ramo da árvore genealógica viral.

Um grupo de coronavírus que compartilham o mesmo conjunto herdado de mutações distintas é chamado de variante. Se mutações suficientes se acumulam em uma linhagem, os vírus podem desenvolver diferenças nítidas em como funcionam. Essas linhagens passaram a ser conhecidas como cepas . Covid-19 é causado por uma cepa de coronavírus conhecida como SARS-CoV-2.

Ao longo da pandemia, surgiram várias variantes do SARS-CoV-2. Alguns deles estão levantando preocupações de que possam prolongar a pandemia ou tornar as vacinas menos eficazes.

Notícias e atualizações
7 de fevereiro A África do Sul para de usar a vacina da AstraZeneca contra a variante B.1.351 .
7 de fevereiro A variante B.1.1.7 está dobrando a cada 10 dias nos Estados Unidos.


Variantes de preocupação
Linhagem Nome da variante Status
B.1.1.7 Variante da preocupação 202012/01 ou 501Y.V1 Surgiu na Grã-Bretanha em dezembro e é cerca de 50% mais infeccioso. Agora detectado em mais de 70 países e 33 estados.
B.1.351 501Y.V2 Surgiu na África do Sul em dezembro. Reduz a eficácia de algumas vacinas.
P.1 501Y.V3 Surgiu no Brasil no final de 2020. Possui mutações semelhantes a B.1.351.


Mutações que podem ajudar a propagação do coronavírus
Linhagem Mutação Status
B.1 D614G Surgido no início de 2020 e se espalhando pelo mundo.
De várias N501Y Uma mutação de definição em várias linhagens, incluindo B.1.1.7, B.1.351 e P.1. Ajuda o vírus a se ligar mais firmemente às células humanas.
De várias E484K Aparece em várias linhagens. Pode ajudar o vírus a evitar alguns tipos de anticorpos.
De várias L452R Cada vez mais comum na Califórnia, mas ainda não se mostrou mais infeccioso.


Outras variantes nas notícias
Linhagem Nome da variante Status
B.1.427, B.1.429 CAL.20C Carrega a mutação L452R . Comum na Califórnia, mas ainda não mostrou ser mais infeccioso.

Variantes de preocupação

Coronavírus que parecem ser mais infecciosos do que outros coronavírus circulantes.

A linhagem B.1.1.7

Este grupo de coronavírus surgiu na Grã-Bretanha, onde foi denominado Variant of Concern 202012/01 . A variante também é conhecida como 20I / 501Y.V1 ou simplesmente B.1.1.7 .

Acredita-se que os coronavírus da linhagem B.1.1.7 sejam cerca de 50% mais infecciosos . Após sua descoberta em dezembro, emergiu rapidamente em outros países e cresceu a uma taxa exponencial. Está dobrando nos Estados Unidos a cada dez dias . A evidência preliminar sugere que B.1.1.7 é cerca de 35 por cento mais mortal do que outras variantes. Por outro lado, as vacinas parecem funcionar bem contra ele .

B.1.1.7 parece ser mais infeccioso graças a várias mutações em sua proteína spike, que o coronavírus usa para se ligar às células.

SGF 3675-3677

eliminação

Mutações no

B.1.1.7

LINHAGEM

H69-V70

eliminação

Y144 /

145

B.1.1.7

CORONAVÍRUS

I2230T

N501Y

A570D

P681H

T716I

S982A

A1708D

D1118H

T1001I

Q27stop

R52I

D3L

Y73C

S235F

Começar de

genoma

30.000

Letras de RNA

MUTAÇÕES PRINCIPAIS EM B.1.1.7

As mutações na proteína spike incluem:

- N501Y , que ajuda o vírus a se agarrar mais firmemente às células humanas. Mas a mutação provavelmente não ajudará o vírus a escapar das vacinas atuais.

- P681H , que pode ajudar as células infectadas a criar novas proteínas de pico com mais eficiência.

- As deleções H69 – V70 e Y144 / 145 , que alteram a forma do pico e podem ajudá-lo a evitar alguns anticorpos.

N501Y

Y144 / 145

Y144 / 145

H69 – V70

H69 – V70

P681H

P681H

Mutações chave em

o pico B.1.1.7

São necessárias três proteínas de pico para formar um pico, então cada mutação aparece em três lugares:

Y144 / 145

Y144 / 145

N501Y

N501Y

N501Y

Mutações chave em

o pico B.1.1.7

(vista do topo)

Y144 / 145

Para obter mais informações sobre as mutações B.1.1.7, consulte: Por dentro da variante do coronavírus B.1.1.7 .

ONDE B.1.1.7 FOI ENCONTRADO

A variante foi detectada pela primeira vez no Reino Unido em dezembro, e uma olhada em amostras anteriores descobriu-a já em 20 de setembro.

Reino Unido

RÚSSIA

CANADÁ

NOS

CHINA

NIGÉRIA

MÉXICO

ÍNDIA

BRASIL

AUSTRÁLIA

SUL

ÁFRICA

B.1.1.7 detectado,

normalmente em um viajante

Transmissão local

B.1.1.7 has now been detected in over 70 countries. It was first reported in the United States in January, and has now reached at least 33 states.

B.1.1.7 detected

More than 100 cases

WASH.

MINN.

ORE.

MASS

N.Y.

WIS.

MICH.

CONN.

WYO.

PA.

N.J.

IOWA

DEL.

NEV.

IND.

ILL.

MD.

UTAH

COLO.

VA.

KY.

CALIF.

N.C.

TENN

S.C.

ARIZ.

N.M.

GA.

ALA.

TEX.

LA.

ALASKA

FLA.

Last month, the Centers for Disease Control and Prevention warned that B.1.1.7 could become the predominant source of all infections in the United States by March.

RECENT COVERAGE OF B.1.1.7

The B.1.351 Lineage

A variant known as 20H/501Y.V2, from the B.1.351 lineage of coronaviruses, was first identified in South Africa in December.

Scientists are concerned about the variant because clinical trials of vaccines are showing that they offer less protection against B.1.351 than other variants. People who recover from other variants may not be able to fend off B.1.351 because their antibodies won’t grab the viruses tightly. The F.D.A. is preparing a plan for updating vaccines if the variant surges in the United States.

SGF 3675-3677

deletion

Mutations in the

B.1.351

LINEAGE

L18F

D80A

D215G

R246I

B.1.351

CORONAVIRUS

K417N

E484K

N501Y

A701V

K1655N

mutation

P71L

T205I

Start of

genome

30,000

RNA letters

KEY MUTATIONS IN B.1.351

Mutations near the tip of the spike protein include:

N501Y, which helps the virus latch on more tightly to human cells. This mutation also appears in the B.1.1.7 and P.1 lineages.

K417N, which also helps the virus bind more tightly to human cells.

E484K, which may help the virus evade some kinds of antibodies.

K417N

N501Y

E484K

N501Y

E484K

N501Y

K417N

K417N

E484K

Key mutations in

the B.1.351 spike

(top view)

WHERE B.1.351 HAS BEEN FOUND

The variant spread from South Africa into neighboring countries, and was detected in the United States in January. It has since spread to at least 24 countries.

U.K.

CANADA

U.S.

CHINA

PANAMA

AUSTRALIA

SOUTH

AFRICA

B.1.351 detected,

typically in a traveler

Local transmission

It has been detected in three states: Maryland, South Carolina and Virginia.

B.1.351 lineage detected

MD.

VA.

S.C.

RECENT COVERAGE OF B.1.351

The P.1 Lineage

A variant known as 20J/501Y.V3 is from the P.1 lineage, an offshoot of the larger B.1.1.28 lineage.

The variant was first reported in Japan, in four people who contracted P.1 on a trip to Brazil. The lineage emerged in late 2020 in Manaus, the largest city in Brazil’s Amazon region. It quickly became the predominant variant there and in several other South American cities.

P.1 is a close relative of the B.1.351 lineage, and it has some of the same mutations on the coronavirus spike protein. It may be able to overcome the immunity developed after infection by other variants.

E5665D

SGF 3675-3677

deletion

Mutations in the

P.1 LINEAGE

L18F

T20N

P26S

D138Y

R190S

P.1

CORONAVIRUS

K417T

E484K

N501Y

H655Y

K1795Q

mutation

T1027I

S1188L

E92K

28269-73

insertion

P80R

Start of

genome

30,000

RNA letters

KEY MUTATIONS IN P.1

Key mutations in the spike protein are similar to those in the B.1.351 lineage, although they arose independently:

N501Y, which helps the virus latch on more tightly to human cells. This mutation also appears in the B.1.1.7 and B.1.351 lineages.

K417T, which is the same site as the K417N mutation in the B.1.351 lineage. It may also help the virus latch on tighter.

E484K, which may help the virus evade some kinds of antibodies.

K417T

N501Y

E484K

N501Y

E484K

N501Y

K417T

K417T

E484K

Key mutation

in the P.1 spike

(top view)

WHERE P.1 HAS BEEN FOUND

P.1 was discovered in December and reached the United States in January, but it may have been circulating as early as October in Manaus, Brazil. It has now spread to several countries.

FRANCE

JAPAN

U.S.

Manaus

BRAZIL

P.1 detected,

typically in a traveler

Local transmission

P.1 has been detected in two states: Minnesota and Oklahoma.

P.1 lineage detected

MINN.

OKLA.

PREVIOUS COVERAGE OF MANAUS AND P.1

Mutations of Concern

Single mutations that may make the coronavirus more infectious, or help it avoid antibodies.

The D614G Spike Mutation

The D614G mutation emerged in eastern China early in the pandemic and then quickly spread around the world, displacing other coronaviruses that did not have the mutation.

Location of the

D614G

MUTATION

Genome

D614G

The D614G mutation is thought to make the coronavirus more infections, but it does not appear to make the disease more severe or help the virus escape vaccines.

D614G

The D614G

spike mutation

D614G is so widespread that it has been omitted from other graphics on this page.

PREVIOUS COVERAGE OF D614G

The N501Y Spike Mutation

The N501Y mutation arose independently in several variants of concern, including the B.1.1.7, B.1.351 and P.1 lineages.

Location of the

N501Y

MUTATION

Genome

N501Y

The mutation is near the tip of the coronavirus spike, where it seems to change the shape of the protein to be a tighter fit with human cells.

N501Y

N501Y

N501Y

The N501Y

spike mutation

(top view)

PREVIOUS COVERAGE OF N501Y

The E484K Spike Mutation

The E484K mutation arose independently in multiple lineages, including B.1.351 and P.1. Scientists are also concerned that the mutation was recently found in some samples from the B.1.1.7 lineage from Britain.

Location of the

E484K

MUTATION

Genome

E484K

The mutation occurs near the top of the coronavirus spike, where it alters the shape of the protein. This change may help the spikes evade some types of coronavirus antibodies.

E484K

E484K

E484K

The E484K

spike mutation

(top view)

WHERE E484K HAS BEEN FOUND

E484K has been found in Brazil, Britain, the United States, Canada and Argentina.

RECENT COVERAGE OF E484K

The L452R Spike Mutation

The L452R mutation is not common in the United States, but it has recently spread in California, especially in the Los Angeles area.

Location of the

L452R

MUTATION

Genome

L452R

The mutation appears in several lineages, and was first observed in Denmark in March. It’s possible that the L452R mutation gives the coronavirus an advantage at spreading over other variants, but the results of experiments that will demonstrate that have yet to come.

L452R

L452R

L452R

The L452R

spike mutation

(top view)

WHERE L452R HAS BEEN FOUND

Roughly 45 percent of current samples in California show this mutation.

RECENT COVERAGE OF L452R

Other Variants in the News

These variants have not yet been shown to be more infectious.

The CAL.20C Variant

A variant discovered in California, called CAL.20C, surged in late 2020. The variant spans the B.1.427 and B.1.429 lineages, and carries the L452R mutation listed above. But it’s not yet clear whether it is more infectious.

WHERE CAL.20C HAS BEEN FOUND

By early February, the variant was found in more than half of samples tested in Los Angeles.

PREVIOUS COVERAGE OF CAL.20C



Sources: Bedford Lab, University of Washington; Andrew Rambaut et al. and Nuno R. Faria et al., Virological; Houriiyah Tegally et al., medRxiv; Paul A. Offit et al., Journal of the American Medical Association; Centers for Disease Control and Prevention; GISAID; SARS-CoV-2 lineages. Spike protein model from Ward Lab, Scripps Research. Cahill-Keyes map projection by Gene Keyes.

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Texto original